Lubuntuのバージョン毎にウィンドウマネージャーが異なるためか、CtrlキーとCapsLockキーの入れ替えもまちまちなようです。
試行錯誤の結果、Lubuntu 20.04では以下の方法で入れ替えることができました。
■やり方
/etc/default/keyboardを開き、以下のように修正する。
[修正前]
XKBOPTIONS=""
[修正後]
XKBOPTIONS="ctrl:swapcaps"
マシンを再起動する。
参考サイト
LinuxでCtrlキーとCapsロックキーを入れ替える方法 (色々なウィンドウマネージャでのやり方を解説)